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舜宇光學

在病毒威脅下吃碳水化合物的細菌:科學家們發現了攻擊我們腸道細菌的新病毒群


科學家們描述了以前未知的腸道反應。

嚴格來說,人類無法消化復雜的碳水化合物——這是我們大腸中細菌的工作。加州大學河濱分校的科學家剛剛發現了一組攻擊這些細菌的新病毒。

發表在《細胞報告》上的一篇論文描述了這些病毒以及它們逃避細菌宿主反擊的方式。

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擬桿菌可以占人類大腸中所有細菌的 60%,它們是人們獲取能量的重要途徑。沒有它們,我們將很難消化面包、豆類、蔬菜或其他喜歡的食物。鑒于它們的重要性,令人驚訝的是,科學家們對捕食擬桿菌的病毒知之甚少。

“這在很大程度上是未開發的領域,”領導這項研究的微生物學和植物病理學助理教授、微生物學家帕特里克·德格南 (Patrick Degnan) 說。

為了找到一種攻擊擬桿菌屬的病毒,Degnan 和他的團隊分析了一組細菌基因組,病毒可以在其中隱藏數代,直到某些東西觸發它們復制、攻擊并離開宿主。這種病毒生活方式并非沒有風險,因為隨著時間的推移,可能會發生阻止病毒逃離宿主的突變。

在分析普通擬桿菌的基因組時 Degnan 的團隊發現了屬于他們命名為 BV01 的病毒的DNA 。然而,確定病毒是否能夠逃脫或重新感染其宿主,被證明具有挑戰性。

重建的噬菌體顯微鏡圖像,這是一種攻擊細菌的病毒。來源:普渡大學和 Seyet LLC

“我們嘗試了我們能想到的每一個技巧。在我們使用無菌小鼠模型之前,實驗室中沒有任何效果,”德格南說。“然后,病毒跳躍了。”

這是可能的,因為 Degnan 與 UCR 的同事、合著者和微生物學家 Ansel Hsiao 合作。

這一結果表明哺乳動物腸道中的條件是 BV01 活性的觸發因素。這一發現強調了體外體內實驗對于了解微生物生物學的重要性。

為了尋找有關這種細菌病毒可能對人類產生的間接影響的更多信息,Degnan 的團隊確定,當 BV01 感染宿主細胞時,它會破壞該細胞的正常行為方式。

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“超過 100 個基因改變了它們在感染后的表達方式,”德格南說。

研究人員看來,兩個被改變的基因都負責使膽汁酸失活,膽汁酸對微生物有毒。作者推測,雖然這可能會改變細菌對膽汁酸的敏感性,但也可能會影響細菌被其他病毒感染的能力。

“這種病毒可以進入并改變人類腸道中這些細菌的新陳代謝,這對我們自身的新陳代謝至關重要,”德格南說。

盡管 BV01 感染的全部程度尚不清楚,但科學家們認為,改變腸道細菌豐度和活性的病毒有助于人類健康和疾病。未來研究的一個領域將涉及飲食對 BV01 和類似病毒的影響,因為某些食物會導致我們的身體釋放更多的膽汁。

Degnan 還指出,BV01 只是他的團隊發現的以類似方式起作用的一組病毒之一。該組織名為Salyersviridae,以著名微生物學家 Abigail Salyers 的名字命名,他對腸道細菌的研究推動了抗生素耐藥性的科學發展。

計劃進一步研究以了解這些病毒的生物學特性。

德格南說:“它一直就在眼前,但直到現在還沒有人描述過這一組重要的病毒,這些病毒會影響我們腸道內的物質。”


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